Risolto!!
Grazie Xilolee,ho provato a disattivare il FireWall di Win7 e avviato eMule,funzionava benissimo e le 2 freccette erano ritornate verdi come un tempo!
Allora ho iniziato a scorrere le eccezioni del Firewall e cerano 3 eMule sulla lista,ne ho eliminata 1 perchè le altre 2 non me le faceva eliminare,ho inserito nuovamente l'eccezione su eMule e riattivato il Firewall e riavviato eMule ed ecco che funziona il tutto anche con il Firewall di Win avviato.
Grazie ancora Xilolee.